Ces 31 projets originaux et structurants pour la communauté scientifique correspondent au mieux à l'ADN de la FRM et sont porteurs d'espoir pour apporter des réponses médicales à la pandémie actuelle. Les financements attribués varient de 100 000 € à 200 000 € par projet et peuvent inclure des frais d'équipement, de fonctionnement, de missions et/ou de personnel.

Ces projets répondent à plusieurs objectifs :

• mettre au point des modèles animaux de la maladie
• mettre au point de tests sérologiques
• développer et tester des traitements
• décrypter la réponse immune
• comprendre la dispersion virale
• comprendre les interactions entre le virus et les cellules
• définir le statut immunitaire des patients
• explorer les effets de l'infection sur l'organisme
• développer des tests diagnostiques

Un modèle animal pour améliorer la compréhension de l'infection

L'objectif du projet AM-COV-Path est de développer un modèle de macaque infecté par le virus Sars-CoV-2 pour ensuite étudier les mécanismes de transmission, de dissémination et d'évolution de la maladie.

Coordinateur du projet : Roger Le Grand, Directeur du département Idmit (Infectious Diseases Models for Innovative Therapies), CEA Paris-Saclay, Fontenay-aux-Roses.

Mettre rapidement à disposition de la communauté scientifique des modèles animaux performants

Ce projet vise à développer très rapidement 5 modèles de souris humanisées dont les cellules présentent à leur surface une protéine analogue à celle sur laquelle le virus Sars-CoV-2 se fixe lorsqu'il infecte les cellules humaines. Des vaccins et des thérapies antivirales pourront ensuite être testés sur ces rongeurs. Ces modèles animaux permettront également d'approfondir les connaissances sur les mécanismes infectieux.

Coordinateur du projet : Bernard Malissen, Directeur du Centre d'Immunophénomique à Marseille.

Des tests sérologiques pour évaluer l'immunité dans la population

Le projet CorPopImm contribue à la mise au point des tests sérologiques, des tests qui permettent de détecter dans le sang des anticorps dirigés contre le Sars-CoV-2, signe d'une immunité laissée par l'infection à la Covid-19. Ces tests devront être déployables à grande échelle et efficaces à long terme. Cela permettra par la suite d'évaluer l'immunité de la population face au virus.

Coordinateur du projet : Michael White, équipe « Malaria : parasites et hôtes », Institut Pasteur, Paris.

Identifier des molécules antivirales efficaces pour prendre en charge la maladie

Ce projet vise à identifier des molécules efficaces contre le Sars-CoV-2 parmi des composés antiviraux ayant eu ou ayant une autorisation de mise sur le marché pour le traitement de pathologies autres que les infections virales respiratoires. Leurs effets seront ensuite caractérisés et testés au sein de différents modèles, seuls ou associés à d'autres antiviraux en cours d'évaluation.

Coordinateur du projet : Jean Dubuisson, Responsable de l'équipe « Virologie moléculaire et cellulaire », Centre d'Infection et d'Immunité de l'Institut Pasteur de Lille.

Construction de nanoligands pour bloquer le Sars-CoV-2

Le projet SARS2BlockEntry vise à développer des molécules, des nanoligands, capables de neutraliser le virus Sars-CoV-2 et de l'empêcher de se multiplier dans les cellules pulmonaires. Ces nanoligands pourraient permettre d'obtenir des antiviraux capables de cibler le SARS-CoV-2.

Coordinateur du projet : Bernard Delmas, Responsable de l'Unité de Virologie et Immunologie moléculaires, Institut national de recherche pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement, Jouy-en-Josas

Découverte et développement de nouveaux antiviraux pour le contrôle et le traitement de l'infection

Le projet TargEnt-Covid-19 a pour but d'identifier des facteurs cellulaires qui permettent au virus Sars-CoV-2 d'entrer dans ses cellules hôtes. Il s'agira également de mettre en évidence un ou plusieurs composés capables de bloquer cette action et qui pourraient constituer de futures molécules thérapeutiques.

Coordinateur du projet : Thomas Baumert, Directeur de Institut de recherche sur les maladies virales et hépatiques, Strasbourg

Corimuno-19

La FRM intervient en support de l'ensemble des essais thérapeutiques de la plateforme CORIMUNO-19, en finançant des analyses biologiques et immunologiques chez les patients inclus dans l'étude. Ces examens permettront d'évaluer la réponse au traitement en fonction du profil des patients, afin d'aider les recommandations thérapeutiques et de mieux définir les essais cliniques à venir.

Coordinateurs du projet :

• Dr Pierre-Louis Tharaux, CIC 1418, Hôpital Européen Georges Pompidou, Paris
• Pr Olivier Hermine, Service d'Hématologie adulte, Hôpital Necker Enfants Malades, Paris

CORIPLASM

Cet essai va permettre de tester l'efficacité de l'injection de plasma de patients guéris de la Covid-19 à des patients hospitalisés mais non ventilés. Le plasma de patients guéris contient des anticorps développés par leur organisme et dirigés contre le virus en cause, le SARS-Cov-2. Transfusé à des malades, ce plasma pourrait leur conférer une immunité et les aider à lutter contre la Covid-19.

Le plasma sera collecté par l'Etablissement français du sang (EFS) auprès d'anciens patients convalescents. Cette approche thérapeutique pourrait d'une part éviter à des patients hospitalisés avec une expression légère à modérée de Covid-19 d'être ventilés dans des unités de soins d'urgence actuellement saturées, et d'autre part réduire la mortalité globale due à la Covid-19.

La FRM s'engage également dans l'évaluation fondamentale des résultats de l'étude CORIPLASM à travers des études ancillaires (annexes), ainsi que dans une extension du protocole chez les patients en réanimation (étude CORIPLASMIC).

Coordinateurs du projet :

• Pr Karine Lacombre, AP-HP St Antoine, Sorbonne Université, Paris
• Pr Pierre Tiberghien, Etablissement Français du Sang, La Plaine St Denis/ UMR1098 INSERM/Université de Franche Comté. Découvrir son interview.

Analogues de nucléosides comme médicaments anti-CoV-2

Ce projet vise à découvrir de nouveaux agents thérapeutiques parmi les analogues de nucléosides, une gamme de produits antiviraux utilisés pour prévenir la réplication virale dans les cellules infectées. Une bibliothèque de composés chimiques établie par le laboratoire sera criblée afin de rechercher des composés actifs, capables d'interférer avec des molécules essentielles à la réplication du génome viral. Des modèles cellulaires seront également développés afin d'évaluer les effets des médicaments candidats. Projet de 12 mois.

Coordinateur du projet : Christophe Mathé, Institut des biomolécules Max Mousseron, Montpellier.

Identifier les bases génétiques des formes sévères de Covid-19

Le projet GENCOVID vise à déterminer si les formes sévères de Covid-19 rencontrées chez des personnes jeunes et en bonne santé pourraient être liées à des mutations monogéniques (une erreur dans un seul gène chez un individu), présentes dès la naissance et affectant l'immunité. L'identification des gènes en cause pourrait éclairer les chercheurs sur les mécanismes à l'œuvre dans ces formes graves.

Coordinateur du projet : Jean-Laurent Casanova, Responsable de l'équipe « Génétique humaine des maladies infectieuses : prédisposition monogénique », Institut Imagine, Paris

Observer la réaction immunitaire face au Sars-Cov2 pour découvrir des biomarqueurs et des pistes thérapeutiques

Le projet HARMONICOV consiste à étudier avec précision la réaction immunitaire de l'organisme face à l'infection par le virus Sars-CoV2 afin de révéler des biomarqueurs pronostiques et thérapeutiques, utiles dans le suivi des patients. Ce travail participera également à l'identification d'anticorps qui serviront pour le développement d'une immunothérapie contre le virus.

Coordinateur du projet : Michel Cogné, Etablissement Français du Sang de Bretagne, Rennes.

Caractériser les cellules mémoires spécifiques du virus chez les patients guéris de la Covid-19

Le projet MEMO-COV-2 a pour but de caractériser les cellules immunitaires mémoire des patients guéris de la Covid-19. Ce travail fournira des données qui permettront notamment de modéliser l'immunité collective dans la population et de guider le développement de stratégies vaccinales.

Coordinateur du projet : Simon Fillatreau, Responsable de l'équipe « Immunité normale et pathologique », Institut Necker - Enfants Malades, Paris.

Mettre en évidence des biomarqueurs de sévérité pour élaborer une nouvelle approche thérapeutique dans la Covid-19

Le projet COVID-I2A therapy vise à mettre en évidence chez les patients des biomarqueurs prédictifs d'une inflammation sévère et de lésions au niveau des cellules pulmonaires. Il a également pour objectif de tester l'efficacité de nouveaux composés, en association avec une molécule immunomodulatrice d'intérêt, sur ces deux conséquences de l'infection, à savoir l'inflammation et les lésions cellulaires, ainsi que sur la réplication du virus.

Coordinateur du projet : Jérôme Estaquier, responsable de l'équipe « Physiopathologie de la mort cellulaire dans les relations hôtes-pathogènes », unité « Toxicité environnementale, cibles thérapeutiques, signalisation cellulaire et biomarqueurs », Université Paris-Descartes.

Explorer les effets de l'interféron contre l'infection virale

Le projet IFN-COVID19 a pour but d'explorer comment le Sars-CoV-2 réagit face à une molécule anti-infectieuse produite par le système immunitaire : l'interféron de type I. Actuellement testé dans le cadre d'essais cliniques, le traitement par interféron pourrait s'avérer prometteur pour prendre en charge certaines formes de Covid-19.

Coordinatrice du projet : Marlène Dreux, responsable de l'équipe « Traffic Vésiculaire, Réponse Innée et Virus » au Centre International de Recherche en Infectiologie de Lyon.

Etudier les cellules pulmonaires infectées par le Sars-CoV-2 et la réponse immunitaire dans le poumon

Le projet MUCOLUNG vise à étudier les cellules pulmonaires infectées par le Sars-CoV-2 ainsi que la réponse immunitaire mise en place contre le virus au sein du poumon. L'objectif final est de mieux comprendre les éléments qui interviennent dans la survenue des orages cytokiniques, les réactions inflammatoires inadaptées impliquées dans les formes les plus sévères de la pathologie.

Coordinatrice du projet : Morgane Bomsel, responsable de l'équipe « Entrée muqueuse du VIH et immunité muqueuse » à l'Institut Cochin à Paris.

Comprendre comment le matériel génétique du Sars-CoV-2 stimule le système immunitaire

Le projet SARS-Cov-2immunRNAs vise à caractériser la manière dont le matériel génétique viral présent dans les cellules active les premières lignes de défense de l'organisme. Mieux comprendre ces mécanismes permettra de développer des moyens de stimuler la réponse immunitaire contre les virus et de pallier ses déficiences éventuelles.

Coordinatrice du projet : Anastasia Komarova, Unité de Génétique moléculaire des virus à ARN, Département de Virologie de l'Institut Pasteur à Paris.

Analyse de l'évolution génétique du virus Sars-CoV-2 dans deux grands centres de référence parisiens

Le projet PhyloCoV consiste à effectuer le séquençage génétique de tous les sous-types de virus Sars-CoV-2 identifiés parmi les patients et le personnel médical des deux plus grands centres de référence pour Covid-19 de Paris. Cela permettra d'apporter des données essentielles pour mieux caractériser l'évolution du virus ainsi que sa transmission au sein des hôpitaux.

Coordinateur du projet : Benoît Visseaux, Hôpital Bichat-Claude-Bernard, Unité « Infection, antimicrobiens, modélisation et évolution », Equipe « Decision science in infectious disease prevention and control », Paris.

Explorer les mécanismes moléculaires de la réplication virale

Le projet IDISCOVR vise à explorer les interactions moléculaires qui existent entre le virus Sars-CoV2 et les cellules hôtes lors de l'infection. Cette étude pourrait déboucher sur l'identification de nouvelles cibles exploitables dans le cadre d'interventions préventives ou thérapeutiques contre la maladie.

Coordinateur du projet : Marco Vignuzzi, Responsable de l'équipe « Populations virales et pathogenèse », Institut Pasteur, Paris.

Etude des protéines impliquées dans l'infection

Le projet PROTEO-SARS-CoV-2 a pour but de caractériser les protéines virales et cellulaires cruciales pour l'infection par le virus Sars-CoV-2, ainsi que leurs interactions et leurs modifications au cours du mécanisme infectieux. Cela permettra d'isoler d'éventuelles cibles thérapeutiques exploitables pour développer de futurs traitements.

Coordinatrice du projet : Julia Chamot-Rooke, Responsable du département « Spectrométrie de Masse pour la Biologie » (UTechS MSBio), Institut Pasteur, Paris.

Identifier les cellules initialement infectées par le SARS-CoV-2 et caractériser leur réponse

Le projet ICARE a pour but, grâce à l'utilisation de modèles de poumons humains, d'identifier les types cellulaires initialement ciblés par virus le Sars-CoV-2 et d'étudier les réponses précoces de ces cellules à l'infection. Ce travail pourrait apporter des informations précieuses pour guider la mise au point de stratégies thérapeutiques visant à bloquer l'entrée du virus dans les cellules.

Coordinatrice du projet : Isabelle Schwartz, Responsable de l'équipe « Vaccins Immunopathologie Immunomodulation », Institut national de recherche pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement, Jouy-en-Josas.

Etudier une étape clé de la multiplication du Sars-CoV-2 dans la cellule

Le projet coronaIRES vise à étudier un mécanisme moléculaire qui a lieu lors de la multiplication du Sars-CoV-2 dans la cellule : l'initiation de la traduction du matériel génétique viral. Explorer ce phénomène permettra de développer des molécules capables de le bloquer, en vue de lutter contre l'infection.

Coordinateur du projet : Franck Martin, dans l'équipe « Evolution des systèmes d'initiation de la traduction chez les eucaryotes » à l'Institut de Biologie Moléculaire et Cellulaire de Strasbourg.

Étude d'une protéine essentielle au SARS-CoV-2

Le projet NMR-SARS-CoV-2-ORF8 a pour objectif l'étude de protéines du Sars-CoV-2 qui pourraient être reliées à la virulence de l'infection. Les chercheurs se focaliseront plus particulièrement sur la protéine ORF8 qui constitue une cible intéressante pour le développement de médicaments.

Coordinatrice du projet : Lauriane Lecoq, équipe « RMN du solide des Protéines » au laboratoire « Microbiologie Moléculaire et Biochimie Structurale » de Lyon.

Comprendre comment le Sars-Cov2 se réplique dans les cellules

Le projet CoMemREP vise à explorer la structure de molécules nécessaires à la réplication du Sars-Cov-2 dans la cellule en vue de mettre en évidence de nouvelles cibles thérapeutiques.

Coordinateur du projet : Juan Reguera, équipe « Complexes Macromoléculaires Viraux » au laboratoire « Architecture et fonction des macromolécules biologiques » de l'Université d'Aix-Marseille à Marseille.

Etudier certaines interactions protéiques entre le Sars-CoV2 et ses cellules hôtes

Le projet PDZCov2 a pour objectif d'identifier les interactions qui existent entre une protéine de l'enveloppe du Sars-CoV-2, la protéine E, et certaines protéines présentes dans les cellules humaines, les « protéines humaines à domaine PDZ ». Les chercheurs souhaitent les caractériser et préciser leur rôle dans les cellules infectées en vue d'ouvrir des pistes pour mettre au point des antiviraux.

Coordinateur du projet : Nicolas Wolff, équipe « Signalisation et Interactions Moléculaires », Institut Pasteur à Paris.

Mieux comprendre les mécanismes d'évolution du virus et de son entrée dans la cellule

Le projet COERENT vise à mieux comprendre les mécanismes d'évolution et d'entrée du SARS-CoV-2 dans la cellule hôte afin de concevoir et de tester des molécules antivirales.

Coordinateur du projet : François-Loïc Cosset, équipe « Virus enveloppés, vecteurs et immunothérapie », Centre International de Recherche en Infectiologie, Ecole Normale Supérieure de Lyon

Sapris

La FRM attribue un financement pour la réalisation urgente de collections biologiques et analyses sérologiques répétées qui permettront de caractériser le statut immunitaire des participants des cohortes.

Coordinateurs du projet :

• Pr Fabrice Carrat, Institut Pierre Louis d'épidémiologie et de santé publique, Hôpital Pitié Salpêtrière, Paris.
• Dr Nathalie Bajos, Institut de recherche interdisciplinaire sur les enjeux sociaux, sciences sociales, politique et santé, Campus Condorcet, Aubervilliers.

Quel est le retentissement de l’infection au niveau cérébral ?

Le projet BRAINSTORM vise à créer une base de données à partir de patients atteints de la Covid-19 et présentant un delirium, un état de confusion aigu, signe d’une atteinte cérébrale par le Sars-CoV-2. Il apportera des informations sur les effets du virus au niveau du système nerveux et sur les liens existants entre inflammation systémique et inflammation cérébrale au cours de la maladie.

Coordinateur du projet : Stein Silva, équipe « DEVIN », Toulouse Neuro Imaging Center (TONIC), Toulouse.

Quelle est l'action du Sars-Cov-2 au niveau du système vasculaire ?

Le projet VascCov vise à étudier les mécanismes impliqués dans l'interaction du virus Sars-CoV-2 avec le système vasculaire. Il s'agira notamment de déterminer si le traitement par un inhibiteur de l'enzyme de conversion de l'angiotensine, médicament couramment utilisé en cardiologie, a une action sur la sévérité de la pathologie.

Coordinateur du projet : Andreas Bikfalvi, Laboratoire de l'Angiogenèse et du Microenvironnement des Cancers, Pessac.

Développer un test rapide et fiable de la Covid-19

Le projet RapidCovDiag vise à mettre au point un test diagnostique rapide et fiable de la Covid-19, basé sur la détection d’antigènes viraux présents au sein de prélèvements chez les patients.

Coordinatrice du projet : Claude Nogues, Laboratoire de biologie et pharmacologie appliquée, Ecole Normale Supérieure Paris-Saclay, Gif-sur-Yvette.