Pour analyser très rapidement les effets de mutations dans des gènes ou les effets de produits chimiques issus de l’environnement sur les fonctions vitales des bactéries, le mot clef aujourd’hui est « Haut Débit ». Ce qui veut dire que toutes les étapes depuis la préparation jusqu'à l’analyse des données doivent se faire avec le maximum de processus automatiques.

Une véritable plateforme d’imagerie sera installée dans le Laboratoire de Chimie Bactérienne du CNRS dirigé par Frédéric Barras à l’Institut de Microbiologie de la Méditerranée à Marseille. Le microscope qui sera au centre de ce dispositif aura tous les équipements permettant d’observer les bactéries au sein de différents milieux, avec plusieurs types de sources lumineuses, de lasers et de systèmes d’enregistrement. Le haut degré d’automatisation du système permettra d’enregistrer la même expérience en faisant varier des centaines, voire des milliers, de paramètres sans intervention de l’expérimentateur (banques de mutations génétiques, sources d’énergie, conditions physico-chimiques, agents anti-infectieux, etc.).

Pas moins de sept équipes de chercheurs vont pouvoir bénéficier de l’installation de cet équipement extrêmement performant. Les projets de recherche sont très variés. Ils concernent en particulier :

• l’étude de l’adaptation des bactéries à des changements environnementaux ;
• l’étude du pouvoir pathogène de certaines bactéries ;
• l’analyse de molécules impliquées dans la motilité cellulaire (capacité à effectuer des mouvements), une fonction des cellules qui joue un rôle important dans l’invasion tumorale et la dissémination des bactéries ;
• le développement de micro-robots utilisant les bactéries magnétotactiques – des bactéries capables de s’orienter et de se déplacer le long de lignes de champs magnétiques – pour des applications biomédicales.

	Cet équipement sera acquis en partie grâce une subvention de 220 000 € de la Fondation pour la Recherche Médicale qui a sélectionné cette demande dans le cadre de son appel d’offres « Grands équipements 2010 ».